气质联用仪采用美国PerkinElmer公司生产的质谱仪（Clarus 500 Mass Spectrometer），仪器的样品分离采用PerkinElmer公司生产的气相色谱仪（Clarus 500 Gas Chromatograph），离子源为电子轰击源（EI），质量分析器为四级杆式质量分析器，质量数范围为50-1200amu，扫描速度为5000amu/sec，可以同时进行选择离子扫描和全离子扫描，质谱仪的性能达到了21世纪先进水平。

仪器可用于饱和烃、芳香烃气质分析，进而得到岩石样品中的生物标志物。生物标志物是指发现于地质体中的化学性质稳定、碳骨架结构具有明显生物起源特征的有机化合物，不能单独用气相色谱分析，只能用色谱-质谱( GC-MS)或色谱-质谱-质谱（GC-MS-MS）连用仪分析鉴定，这种联用仪的特点是充分发挥GC的高分离效能和MS的高鉴别能力之特长，这样即使有些化合物分不开，靠质量碎片也能把其鉴别出来。